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计算分子生物学是数学、计算机科学和生物科学业交叉的新兴领域之一。本书覆盖了算法和组合问题的主要领域，并揭示了这些问题是如何同分子生物学和生物技术相联系的。本书包含一个内容丰富的“无公式的计算分子生物学”部分，用相对简单的方式介绍了生物学概念和计算思想，但涉及的内容却是许多基因组基本问题及其结果的核心思想。本书力求通俗的写法表达如何用深刻的数学思想解释复杂的生物学难题，这使得没有经过生物学训练的计算机科学家和只有有限的计算科学背景的生物学家都能够理解本书。本书适合作为数学、计算机科学、生物信息学、生物物理学等交叉学科的教材，也可作为相关专业研究人员的参考书。
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